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En el área de bacteriología, se abordan problemas relacionados con agentes etiológicos de enfermedades, particularmente Escherichia coli causante de síndrome diarreico, teniendo especial interés su patogenia y epidemiología. El estudio se ha centrado en niños menores de cinco años, grupo etario más afectado en nuestra región por este padecimiento. A cepas aisladas de los niños estudiados, se les realizan: caracterización bioquímica, fisiológica y molecular; ésta última para identificar los patotipos que circulan localmente, así como los grupos filogenéticos a los que pertenecen. Adicionalmente, se investigan sus patrones de resistencia a los antimicrobianos.

También resulta de nuestro interés la exploración de alternativas terapéuticas, dada la importancia del fenómeno de resistencia a los antimicrobianos. Se han probado diversos extractos naturales obtenidos de frutos típicos de nuestra región y su efecto en bacterias ATCC y aisladas de niños con diversas enfermedades. Por otro lado, se realizan estudios de contaminación ambiental de agua en drenes agrícolas y granjas acuícolas de peces y camarón; en estas últimas, el estudio de calidad microbiológica también se realiza en las especies que ahí se cultivan.

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